To δυστύχημα συνέβη στο Φιλοτράνο, όταν ο Σκαρπόνι συγκρούστηκε μετωπικά με ένα φορτηγό. Οι δεκάδες οδηγοί που σταμάτησαν αμέσως ειδοποίησαν ασθενοφόρο και από την Ανκόνα σηκώθηκε ελικόπτερο για να τον παραλάβει αλλά δυστυχώς ο θάνατος του ήταν ακαριαίος.
Ο Σκαρπόνι ήταν κάτοχος του τίτλου του γύρου της Ιταλίας , το 2011 και θεωρείτο ένας από τους καλύτερους Ιταλούς ποδηλάτες.
«Ο αθλητής μας, Μικέλε Σκαρπόνι, σκοτώθηκε σήμερα το πρωί, την ώρα που έκανε προπόνηση, κοντά στο σπίτι του στην πόλη Φιλοτράνο», αναφέρεται χαρακτηριστικά στην ανακοίνωση της ομάδας του.