Αθώοι κρίθηκαν από το Τριμελές Εφετείο Κακουργημάτων οι 138 κατηγορούμενοι, κυρίως πανεπιστημιακοί, που είτε μέσω της Συγκλήτου είτε μέσω της Επιτροπής Έρευνας του Πανεπιστημίου Κρήτης διαχειρίστηκαν ποσά του Ειδικού Λογαριασμού Κονδυλίων Έρευνας (ΕΛΚΕ).
Το δικαστήριο έκρινε πως δεν υπήρξε βλάβη για το Δημόσιο και για τον λόγο αυτό έκρινε αθώους τους καθηγητές, το διοικητικό προσωπικό και τους φοιτητές που συμμετείχαν στην Σύγκλητο.
Αξίζει να σημειωθεί ότι η Δίκη πραγματοποίηθηκε στην αίθουσα “ΠΟΣΕΙΔΩΝ” του Μεσογειακού Αγρονομικού Ινστιτούτου Χανίων, καθώς δεν υπήρχε στην Κρήτη άλλη αίθουσα να φιλοξενήσει τόσο μεγάλο αριθμό κατηγορουμένων.
